พระพุทธ
ได้แก่ พระพุทธรูปปางปฐมเทศนา พระประธานประจำพิพิธภัณฑ์ฯ และพระพุทธประวัติของพระพุทธเจ้า ๒๙ พระองค์ ซึ่งจัดแสดงไว้รอบห้องโถงใหญ่
พระธรรม
ได้แก่ ปฏิจจสมุปบาท, อริยสัจ 4, เสาธรรมะ ประกอบด้วยเสาอริยสัจ 4, เสาธรรมจักกัปปวัตตนสูตร, เสาไตรสิกขา, เสาโพธิปักขิยธรรม 37 ประการ และเสารอมฤตพจนา – พุทธศาสนสุภาษิต
พระสงฆ์
ได้แก่ รูปปั้นพระบูรพาจารย์ด้านอภิญญา ทั้งทางด้านทรงปฏิปทาธุดงค์คุณ ทั้งด้านทรงปฏิปทาเอื้อมหาชน จัดแสดงประวัติและโอวาทธรรมโดยย่อ รวมถึงธรรมเทศนาของแต่ละท่าน เช่น เรื่องมุตโตทัย แนวทางปฏิบัติให้ถึงความหลุดพ้น โดยพระอาจารย์มั่น ภูริทัตโต เป็นต้น
นอกจากนี้ เนื่องจากพื้นที่ของโซนพิเศษ เป็นพื้นที่โล่งกว้าง มีห้องโถงใหญ่สำหรับกิจกรรมคนหมู่มาก และมีห้องย่อยเฉพาะสำหรับกิจกรรมกลุ่มย่อย รวมถึงได้จัดหาติดตั้งอุปกรณ์เทคโนโลยีด้านภาพและเสียงแบบครบวงจร เพื่ออำนวยความสะดวกในการจัดกิจกรรมเนื่องในโอกาสพิเศษต่างๆ เช่น การประชุมสัมมนา การอบรม เทศนาธรรม และปฏิบัติธรรม เป็นต้น
ทางพิพิธภัณฑ์ฯ หวังเป็นอย่างยิ่งว่า เนื้อหาที่ได้จัดแสดงไว้รวมทั้งหมด 12 โซนหลัก และโซนพิเศษดังที่กล่าวมาทั้งหมด จะก่อเกิดกุศลคุณประโยชน์ สร้างศรัทธาและแรงบันดาลใจต่อผู้ที่ได้มาเยี่ยมชม ให้เกิดมีความเพียรพยายาม ศึกษาและปฏิบัติจนได้รู้แจ้งแทงตลอดตามแนวทางแห่งพุทธธรรมขององค์สมเด็จพระสัมมาสัมพุทธเจ้า เพื่อเมืองไทยจะได้เป็นศูนย์กลางพระพุทธศาสนาของโลก อันจะนำมาซึ่งความสงบสุขและนำพาโลกของเราให้เกิดสันติสุขอย่างแท้จริง
พระบรมสารีริกธาตุ และพระอรหันตธาตุ
พิพิธภัณฑ์ฯ ได้รับความอนุเคราะห์จากวัดสุนันทวนารามที่ได้จัดแบ่งพระธาตุที่เหลือจากการบรรจุในพระเจดีย์ของวัด นอกจากนี้ต้องขอขอบคุณชมรมพุทธปัญญาบารมี และครอบครัวของคุณพ่อสวงค์ ทนุสินธ์ ที่ได้มอบพระบรมสารีริกธาตุและพระอรหันตธาตุให้แก่พิพิธภัณฑ์ฯ เพื่อจัดแสดงไว้ให้ประชาชนทั่วไปได้ศึกษาเรียนรู้และได้กราบไหว้สักการะบูชา